阿里云数据库 MongoDB 版整理物理空间碎片以提升磁盘利用率

前提条件

实例的存储引擎为WiredTiger。

注意事项

• 执行该操作前，建议对数据库进行备份，详情请参见手动备份MongoDB数据。
• 执行该操作会导致集合所属的数据库被锁定，且该数据库的读写操作将被阻塞，请在业务低峰期操作。

  
  说明 执行物理空间回收命令（compact）所需的时间与集合数据量、系统负载等因素有关。

背景信息

通常情况下，使用db.collection.remove({}, {multi: true})命令删除文档，文档将从btree中删除，但是文档占用的物理空间不会被回收。如果执行remove命令删除了大量的文档，且后续的数据写入操作很少，这将降低磁盘利用率，此时可执行compact命令回收空闲的物理空间。

说明

• 新写入的数据将会使用未被回收的物理空间，所以在数据持续写入的场景中，不需要频繁执行compact命令整理物理空间碎片。
• 如您使用db.collection.drop()命令删除集合，那么集合的物理文件会被删除，且物理空间会被回收。

预估回收的物理空间

1. 通过mongo shell连接MongoDB实例，详情请参见：
   • Mongo Shell连接单节点实例
   • Mongo Shell连接副本集实例
   • Mongo Shell连接分片集群实例
2. 切换至集合所在的数据库。

   use <database_name>

   
   说明 <database_name>：数据库名。

3. 执行下列命令查询。

   db.<collection_name>.stats().wiredTiger["block-manager"]["file bytes available for reuse"]

   
   说明 <collection_name>：集合名。

   查询示例：

   db.customer.stats().wiredTiger["block-manager"]["file bytes available for reuse"]

   执行结果示例：

   207806464

整理单节点实例/副本集实例的碎片

1. 通过mongo shell连接MongoDB实例的Primary节点，详情请参见mongoshell连接实例。
2. 切换至集合所在的数据库。

   use <database_name>

   
   说明 <database_name>：数据库名。

3. 执行db.stats()命令查看碎片整理前数据库占用的磁盘空间。
4. 执行以下命令，对某个集合进行碎片整理。

   db.runCommand({compact:"<collection_name>",force:true})

   
   说明

   • <collection_name>：集合名。
   • force为可选项，如您需要在副本集实例的Primary节点执行该命令，需要设置force的值为true。
5. 等待执行，返回{ "ok" : 1 }代表执行完成。

   
   说明 compact操作不会传递给Secondary节点，当实例为副本集实例时，请重复上述步骤通过mongo shell连接至Secondary节点，执行碎片整理命令。

   碎片整理完毕后，可通过db.stats()命令查看碎片整理后数据库占用的磁盘空间。本案例碎片整理前后的对比如下图所示。
   

整理分片集群实例的碎片

1. 通过mongo shell连接分片集群实例中的任一mongos节点，详情请参见mongo shell连接分片集群实例。
2. 执行db.stats()命令查看碎片整理前数据库占用的磁盘空间。
3. 执行以下命令，对Shard节点中的Primary节点进行集合的碎片整理。

   db.runCommand({runCommandOnShard:"<Shard ID>","command":{compact:"<collection_name>",force:true}})

   
   说明

   • <Shard ID>：Shard节点ID。
   • <collection_name>：集合名。
4. 执行以下命令，对Shard节点中的Secondary节点进行集合的碎片整理。

   db.runCommand({runCommandOnShard:"<Shard ID>","command":{compact:"<collection_name>"},queryOptions: {$readPreference: {mode: 'secondary'}}})

   
   说明

   • <Shard ID>：Shard节点ID。
   • <collection_name>：集合名。

   碎片整理完毕后，可通过db.runCommand({dbstats:1}) 命令查看碎片整理后数据库占用的磁盘空间。

相关问题

解决因磁盘空间耗尽导致的锁定/无法写入问题